Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms