Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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