Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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CHD4Q14839 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHD4Q14839 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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