Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms