Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IKBKEQ14164 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms