Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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SHROOM2Q13796 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHROOM2Q13796 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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