Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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