Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PWP1Q13610 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PWP1Q13610 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms