Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SGCGQ13326 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCGQ13326 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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