Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN3Q13286 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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