Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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