Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.31□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)20.25■□□□□ 0.839e-7■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 219.04■□□□□ 0.649e-7■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-214ENST00000505777 576 ntTSL 421.21■□□□□ 0.992e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-203ENST00000464068 657 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-205ENST00000468022 662 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-210ENST00000489361 417 ntTSL 34.71□□□□□ -1.662e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 UBA5-206ENST00000468227 3902 ntTSL 22.14□□□□□ -2.072e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-205ENST00000547736 574 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-207ENST00000551769 560 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-206ENST00000547943 552 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 COQ5-208ENST00000552443 972 ntTSL 211.3□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 SMG7-209ENST00000495321 556 ntTSL 36.82□□□□□ -1.323e-9■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 414□□□□□ -0.179e-7■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.993e-6■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.74□□□□□ -2.132e-7■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.442e-12■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.442e-12■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.699e-11■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 25.45□□□□□ -1.549e-11■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 PRIM2-203ENST00000419977 2197 ntTSL 25.31□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 216.99■□□□□ 0.317e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.317e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 216.68■□□□□ 0.267e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 NDUFA11-206ENST00000593233 657 ntTSL 316.31■□□□□ 0.27e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-8■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-6■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 MAPK14-205ENST00000472333 585 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-6■■□□□ 12.7
TARDBPQ13148 STAT6-207ENST00000553397 553 ntTSL 414.65□□□□□ -0.065e-12■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 STAT6-221ENST00000556259 548 ntTSL 37.38□□□□□ -1.235e-12■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 518.51■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-6■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.26e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.836e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-203ENST00000561965 1712 ntTSL 516.55■□□□□ 0.246e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.046e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.236e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-215ENST00000575677 570 ntTSL 311.6□□□□□ -0.556e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-211ENST00000568099 540 ntTSL 511.12□□□□□ -0.636e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-209ENST00000566306 544 ntTSL 48.75□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-213ENST00000570709 569 ntTSL 48.74□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 DUS2-204ENST00000562246 736 ntTSL 28.56□□□□□ -1.046e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.346e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.436e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PHC3-216ENST00000497171 420 ntTSL 24.1□□□□□ -1.756e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PHC3-210ENST00000484931 657 ntTSL 53.72□□□□□ -1.816e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.826e-7■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.266e-8■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-9■■□□□ 12.6
TARDBPQ13148 TCF12-219ENST00000560836 212 ntTSL 310.64□□□□□ -0.715e-9■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 TCF12-221ENST00000560948 440 ntTSL 26.34□□□□□ -1.395e-9■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-210ENST00000510954 533 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-209ENST00000508896 585 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 12.5
TARDBPQ13148 GNAS-256ENST00000603546 573 ntTSL 527.67■■■□□ 2.021e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 227.5■■□□□ 1.991e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 527.5■■□□□ 1.991e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 326.46■■□□□ 1.831e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 526.46■■□□□ 1.831e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 226.46■■□□□ 1.831e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 225.61■■□□□ 1.691e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 525.35■■□□□ 1.651e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 525.01■■□□□ 1.591e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 323.86■■□□□ 1.411e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.381e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.241e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 521.37■■□□□ 1.011e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 518.98■□□□□ 0.631e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 518.93■□□□□ 0.621e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.541e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.378e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF420-208ENST00000589461 537 ntTSL 516.67■□□□□ 0.268e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-12■■□□□ 12.4
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 730.4 ms