Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CALCOCO2Q13137 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CALCOCO2Q13137 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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