Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSTF3Q12996 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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