Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRJQ12913 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRJQ12913 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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