Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPAL4Q0D2K0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms