Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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