Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms