Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms