Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4BQ07343 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms