Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms