Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN11Q06124 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms