Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNEQ04844 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms