Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms