Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POU5F1Q01860 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms