Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms