Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1BQ00975 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms