Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSNK2A1P68400 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms