Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS4XP62701 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS4XP62701 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms