Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVS71-1P61550 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms