Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms