Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABP4P57796 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABP4P57796 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms