Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCBP3P57721 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms