Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms