Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIK1P57059 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIK1P57059 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIK1P57059 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms