Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BGRP55822 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms