Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFSP49914 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFSP49914 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms