Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTPAP49638 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTPAP49638 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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