Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCLMP48507 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCLMP48507 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms