Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA2P47869 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms