Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms