Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBRP36941 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBRP36941 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBRP36941 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms