Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms