Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1AP35321 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms