Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNB1P35222 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms