Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKARP32238 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCKARP32238 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms