Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TSPOP30536 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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