Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHC1P29353 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHC1P29353 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SHC1P29353 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SHC1P29353 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHC1P29353 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHC1P29353 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHC1P29353 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SHC1P29353 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms