Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2E1P29083 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms