Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD34P28906 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD34P28906 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD34P28906 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms